12 мая 1922 года в Александро-Невской лавре устроено публичное вскрытие и осмотр мощей святого Александра Невского. Присутствовали представители воинских частей, предприятий, парторганизаций, митрополит Вениамин. «Петроградская правда»: «Эксперты определили, что здесь имеются две неполные берцовые кости, одно ребро, остатки от височных костей и ключиц… Верующие разочарованы…»
По учению православной церкви, «мощи – оставшиеся нетленными после смерти тела христианских святых, которые должны чтиться также, как и иконы, но не должно воздавать им честь, приличную одному Богу». Дни обретения и перенесения мощей церковь отмечает как особые праздники. Однако нетленность тел «почивших святых людей» не является главным или даже обязательным атрибутом почитаемых мощей. В православном катехизисе содержится следующее разъяснение: «Тела некоторых усопших святых сохраняются в сравнительной или даже полной целостности. Но почитаются они отнюдь не за их всегда бывшую нетленность, а за то, что по причине святости почивших тел их и по смерти являются хранителями Божественной благодати, силою которой подаются верующим дары исцелений и другие духовные дарования».
Все эти обстоятельства, важные для церковного почитания мощей, не учли организаторы антирелигиозной кампании, поскольку исходили из того, что осмотр содержимого рак выявит тленность останков святых и тем самым «разоблачит перед массами вековой обман церковниками трудового народа».
Серебряная рака князя была изъята и по частям на грузовиках перевезена в Эрмитаж. Эту операцию осуществили одиннадцать слесарей и один ювелир, которые еще 9 мая были выделены исполкомом 1-го городского района в распоряжение заведующего отделом управления Ершова, отвечавшего за демонтаж и перевоз раки в Эрмитаж. Однако сами мощи лаврскому духовенству во главе с митрополитом удалось тогда отстоять – шкатулка с ними после осмотра была запечатана и, вопреки циркуляру наркомата юстиции от 25 августа 1920 года о конфискации мощей и передаче их в музеи, помещена на хранение в алтаре Троицкого собора Александро-Невской лавры.
Мощи были конфискованы властями лишь осенью 1922 года. Долгие годы останки защитника Русской земли князя Александра Ярославича находились в Музее истории религии и атеизма. В связи с празднованием 1000-летия крещения Руси государственные органы стали возвращать церкви некоторые православные святыни, уцелевшие в период гонений и утрат. Одними из первых были возвращены мощи святого благоверного князя Александра Невского, по давней традиции являющегося небесным покровителем нашего города. 3 июня 1989 года останки князя были торжественно перевезены из музея в Троицкий собор Александро-Невской лавры.